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北京大学教授张泽民、研究员任仙文联合首都医科大学附属北京世纪坛医院教授彭吉润,基于结直肠癌肝转移临床患者肿瘤转移灶,对免疫细胞特征进行了深入刻画。3月17日,相关研究发表于《癌细胞》。
“目前,肿瘤微环境特征与癌症免疫疗法已经建立起密切联系,然而不同肿瘤之间微环境的异同及其影响因素却仍在早期探索阶段。”张泽民告诉《中国科学报》,这些问题在单一癌种单一器官类型中难以回答,而该团队研究的结直肠癌肝转移标本能为此提供思路。
由于临床样本的稀缺性和取样的复杂性,课题组历时5年,收集了超过17例结直肠癌患者的100余例配对临床样本,并进行单细胞转录组测序实验。同时,研究者对实验室已建立的原发肝癌和原发结直肠癌患者的单细胞转录的数据进行回顾性分析,并与该研究中新产生的结直肠癌肝转移数据进行系统比较。
基于珍贵的临床数据,结合实验室开创的特殊生物信息学分析方法PhenoAligner,研究者首次对肿瘤转移灶中免疫细胞表型进行归类,揭示了肿瘤内在因素与器官类型因素对肿瘤转移灶浸润的免疫细胞的影响。
研究者首先揭示了免疫细胞表型的不同影响因素。其中,肥大细胞的表型主要受肿瘤内在特征影响,而树突状细胞与自然杀伤细胞则主要受器官类型微环境的影响,其他细胞类型则受多种因素影响。
研究者对单细胞数据所揭示的多种细胞亚型进行解析。对于T细胞亚型,该团队之前的研究工作所强调的肿瘤中富集的耗竭性T细胞、I型辅助性T细胞以及调节性T细胞均主要受肿瘤本身的影响,该影响进一步被报道通过T细胞受体进行关联。对于髓系细胞亚群,团队之前所强调的高表达SPP1(骨桥蛋白)的巨噬细胞也主要受肿瘤内在因素影响。同时,该研究揭示了该类细胞的促转移表型,强调了针对该类细胞设计药物靶点的重要性。此外,研究者在肿瘤转移灶发现两种状态的树突状细胞,分别受肿瘤本身和器官类型的影响较大,揭示了不同树突状细胞在肿瘤中的不同作用。(记者崔雪芹)
相关论文信息:
https://doi.org/10.1016/j.ccell.2022.02.013